骨髓移植手术前的化疗基本摧毁了受体原有的骨髓造血系统，骨髓移植成功后，经历约1个月的时间，患者临床症状逐步好转，此时血液STR基因型发生改变，与供体一致，这是移植手术成功的一项观察指标。这种改变不同于输血，输血2-3个月后，由于受体自身造血的补充，其血液里的异源DNA会连渐消失且输血一般不会造成受体上皮细胞基困型的改变。
在法医实践中，异型骨髓移植后患者外周血基因型改变或者嵌合体的形成，必然会对法医学个体识别以及亲子鉴定造成影响，有时会导致错误鉴定结论的发生。在多数情况下，尤其是在骨髓移植后的短时间内，受者外周血出现供者的微卫星类型，而受者的口腔黏膜细胞仍然为其原来的类型。因此，时于接受过骨髓移植手术的受检者，采用口腔拭子作为样本进行检测分析优于血液样本。但由于干细胞属于早期未分化细胞，干细胞移植同样会导致口腔上皮细胞基因型的转变。如果采用口腔拭子作为样本得到的检验结果出现与血样相同或者出观嵌台体时，可以选择毛发作为检验样本。
STR分析技术已经被广泛地应用于法医学个体识别及亲子鉴定中，并儿随着该项技术的不断突破，使得对包括血液、毛发、口腔上皮细胞及各种组织等不同部位检验样本的选择更具有多样性和灵活性。与此同时，随着采用外周血干细胞、脐血干细胞以及骨髓移植技术治疗各种血液恶性疾病病例的逐年增加，对于这类术后病人的亲子鉴定，不同部位检验样本的选择直接影响DNA鉴定结果的可信度。
因此，一般亲子鉴定采集血样的时候要求被鉴定者半年甚至一到两年内没有做过骨髓移植和输血手术。如果有这些可能，建议采集口腔拭子作为亲子鉴定的样本。
