简单的讲亲子鉴定判定亲子关系是否定的是100%排除亲子关系，肯定是亲权概率大于99.99%的。那么怎么会存在两次亲子鉴定结果不一致吗？如何辨别？
首先，DNA鉴定技术是实践科学发展起来的。
DNA鉴定也称为法医DNA分析，同其他科学一样是在长期的社会实践中，特别是在司法鉴定实践中逐步形成并发展起来的。DNA鉴定包括亲权鉴定和个体识别，它是指应用生物学和遗传学理论知识与技术，通过检测分析人类的遗传学标记，判断个体之间的亲缘关系和现场检材的来源。
再者，个体的DNA数据和亲子关系是客观存在的。
亲子鉴定即DNA鉴定是STR分型检测技术在生活中的应用。STR分型检测标记的人类21个位点的数据，一般是终身不会改变的。亲子鉴定技术的第一步是提取样本的DNA，第二步是测序检测出留样者的DNA数据，第三步是分析亲子关系了。其原理是孟德尔遗传学，根据遗传学的规律联合应用亲子关系分析，其非父排除率是大于0.9999的。这是这项技术固有的客观存在的现象。
那么两次亲子鉴定结果出现不一致的话，如何辨别？
第一、从技术的角度上。得看亲子鉴定报告的数据了，同一个人其DNA数据是一样的；比较两次鉴定的数据是否一样，如果不是一样的，两次检测的就不同人的样本。
第二、从亲子鉴定机构上。选择正确的亲子鉴定中心。DNA亲子鉴定不管是做个人的还是司法的，都是需要出具书面报告的。书面报告就是一份很好的证据证明，有据可查。
第三、从知识面上。做亲子鉴定之前最好是了解一下亲子鉴定的相关知识。可以直接去鉴定中心现场获得。亲子鉴定原理呀？怎么判断的？亲子鉴定判定的标准。这些都是有理有据的。也是正规的鉴定中心可以讲解的。
相关评论：
科鉴基因来自河北石家庄的客户反馈：北京做了三次亲子鉴定，结果以及相同位点的数据是一样的；跟先前检测结果不一致，是因为前后检测孩子的样本来源不是同一个人。
2016年在北京三家做了同一父子的亲子鉴定。结果都是肯定。其目的是为了证实在河北做的否定的结论错误的。北京不同的三家亲子鉴定出具的书面报告结果都是肯定，且相同的位点的数据也是一样的。证实到北京三家的鉴定结果父亲和孩子都是来源同一个人的，跟河北做的亲子鉴定父亲也是来自同一人的，不同的孩子北京和河北做的孩子数据不一样。应该是孩子的样本被调换过。
科鉴基因来自江西的客户反馈：做了四次亲子鉴定，结果一致，但是亲权指数不一样。
2019年选择在北京重新做了一次亲子鉴定。好让自己放心，先前在国内不同的鉴定机构已经做过了三次亲子鉴定。结果也是一样的，亲权指数不一样，看网上看了很多资料，发觉北京科鉴基因的资料解释得比较专业，又选择北京重新验证了一遍。并还让工作人员讲解了一遍。知道了存在不同的基因分布频率，还有检测的位点差一到两个，还有相同的数据，不同的人计算，保留的小数点后面有效数字不一样，其结果的亲权指数都有所变化。再也不纠结了，感谢鉴定中心不厌其烦的解答。
