母子之间是可以做亲子鉴定的。
母女或母子和父子或父女鉴定都是一样的，都是二联体亲子鉴定。且在计算母权指数与父权指数也是一样的。判断标准也是一样的，都是需要满足所检测的人类基因位点符合遗传规律且累计母权指数（父子或父女鉴定为父权指数）大于9999。
由于DNA的突变概概率在1.4%左右，尽管亲代到子代遗传的过程中会发生基因突变的现象，当发生突变时一般需要增加基因位点或是提供另外未参与方样本做三联体亲子鉴定，但是亲代到子代遗传过程中的大部分突变现象的发生都是在父子或父女之间，母女或母子目前还没有为案例出现（不排除有可能出现的现象）。
母女或母子鉴定相对于父子或父女鉴定要少很多，个人亲子鉴定中一般是怀疑医院报错孩子确认一下或找到丢失的孩子的确认一下，司法亲子鉴定中一般是非婚子与母亲做亲子鉴定落户到母亲的户口所在地（政策上一般是有2016年1月1日出生的孩子随母亲落户有出生医学证明就可以上户，有异议的就是非婚生子的需要做司法亲子鉴定落户），或是孩子随母亲改嫁落户到男方的户口所在地，或是有孩子有随母亲出国的需要。
