亲子鉴定原理依据的是孟德尔遗传学。子女的基因型一半来自母亲，另一半来自父亲。

亲子鉴定结果文字描述：

肯定的结果：支持检材1是检材2的生物学父亲、母亲；支持检测1和检材2存在亲子关系。

否定的结果：排除检材1是检材2的生物学父亲、母亲；不支持检测1和检材2存在亲子关系。

亲子鉴定行业标准数据：

肯定的结果：累积亲权指数大于10000，亲权概率大于99.99%；

否定的结果：累积亲权指数小于0.0001。

亲子鉴定基因座位点比对：

肯定的结果：所检测的21位点或40个位点都是符合遗传规律；（或者有1-2个位点不符合，可能存在基因突变现象）

否定的结果：三个以上位点不符合遗传规律。

亲子鉴定的报告的咨询意见有：
      在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下，支持被检父亲（检材1的留言者）是（或不是）孩子（检材2的留样者）的生物学父亲，在上述基因座中，从遗传的角度已经得到科学合理的确信。
      或描述为：
      在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下，根据DNA遗传标记分型结果，支持（或不支持）检材1和检材2存在亲子关系。
      解读同卵多胞胎、近亲及外源干扰三种需要排除的情况：

      1、同卵多胞胎
      如果可疑父亲A和可疑父亲B是同卵双胞的话，则用STR分型检测方法检测两者的样本，可以得到两者的DNA数据是完全一样。因此，在生理上，可疑父亲A生育的孩子，跟可疑父亲B在数据分析比对时，肯定也是存在与亲生父亲相同的结果，存在亲子关系。

      2、近亲
      近亲关系的中心的两者DNA数据比对，因为是近亲，相似的基因可能比较多，也会出现21个基因座位点的检测出现和亲子关系一样的现象。如父亲同侧基因座遗传现象。其21个基因座位点的检测，同父的两个孩子出现父亲同侧基因座遗传的概率为二分一的20次方。如果有纠结这个概率的存在，提供怀疑近亲的那个样本，检测出DNA数据，参与分析亲子关系，用排除法来判定存在的可能性。

      3、外源干扰
      外源干扰一般是针对提供的样本，采集时没有知情留言者的情况。一般指血痕和口腔拭子的样本。血痕样本一般要求近期没有做过输血手术或是骨髓移植的，以防采集到输血者的样本或是提供骨髓者的遗传基因；口腔拭子样本一般要求吃母乳的小孩，若是刚吃完母乳需要半小时后采集口腔黏膜细胞，因母乳中含有母亲的DNA信息。

      以上三种情况，在亲子鉴定咨询意见中，都会作出说明，不管是有还是无，都会写鉴定意见中，足见科学技术的严谨性。