胎囊是可以用于做亲子鉴定。胎囊即流产物，作为用于做亲子鉴定的样本，一般最好是母亲也参与鉴定做父母子三人的三联体亲子鉴定。原因如下：
三个月内的流产物样本数据，一般是母亲与胎儿的混合数据，就是两个人的数据的重叠，需要母亲参与进来检测出母亲个人分型的DNA数据，以母亲个人分型的数据为参考部分从混合数据中剥离出胎儿的DNA数据，原后与可疑父亲样本做亲子关系分析。
三个月后的流产物样本数据，一般是流产物的个人分型数据，可以直接与可疑父亲样本做亲子关系分析。此时也建议母亲参与，因流产物来自母亲，鉴定出流产物的DNA信息也可能是母亲的DNA数据（但是一般都是胎儿的DNA数据），如果有母亲的个人分型DNA数据，与流产物样本的DNA数据比对非同一人那就确定为胎儿的DNA信息。当然如果母亲不参与，鉴定出来流产物的样本信息是男性的那肯定是胎儿的DNA信息（但一般未出生的，性别会在书面的报告上不体现即使是流产物），同样鉴定出来流产物的样本信息与可疑父亲是亲子关系的那也可确定是胎儿的DNA信息了（一般母亲与父亲两者DNA信息分析亲子关系是否定的）。
