亲子鉴定是对亲子关系客观真实的反应，可以说亲子鉴定技术是可以100%确认亲子关系的。这就是为什么亲子鉴定技术是可以用于法医物证鉴定，应用到司法鉴定方向。亲子鉴定对亲子关系的判定是毋庸置疑的，有些人对亲子鉴定的结果的怀疑，在考虑到样本是否存在调换的情况，是完全可以通过在不同鉴定结构进行检测验证确认的。
亲子鉴定是对亲子关系的客观真实反应，那么常说的精确度大于99.99%是怎么看？
亲子鉴定技术是可以准确的确认亲子关系。其精确度大于99.99%，是从技术科学数据上对亲子鉴定技术确认亲子关系的质量控制。亲子鉴定技术遵循的是孟德尔遗传学，子女的基因型一半来自母亲，另一半来自父亲。这个从得到的两者的DNA数据比对，看大人和小孩相同的遗传标记位点是否有相同的数字，即相同的遗传密码子。根据该遗传密码子在人群中的分布频率，来计算得到两者的亲权指数。累积检测的遗传标记基因座位点来确认累计亲权指数，从而作为一个控制需要检测的基因座位点数量,这个累计亲权指数数值已经规定为10000，当累计亲权指数为9999时，其亲权概率为99.99%。因此，只要所检测的位点累计亲权概率大于10000时，就可以给出符合标准的鉴定意见；如果达不到，则需要增加检测基因座位点。故，亲子鉴定的检测标准是以21位点的检测为准，40位点为辅的。可以科学的方法准确的判定亲子关系。
亲子鉴定对亲子关系的客观真实反应，对排除同卵多胞胎和近亲以及外源干扰的情况是严谨的科学描述。
亲子鉴定技术能客观真实反应自然界人类亲属关系中的父母亲与孩子的亲子关系。但是在对亲子鉴定的描述中，会提供在排除同卵多胞胎和近亲以及外源干扰的情况下，才给出支持和排除的亲子关系。这个三个方面的原因，在每次亲子鉴定检测结论都会写，不管是有还是没有，都不会提到，足见科学技术的严谨性。那么这些情况是不是会影响亲子鉴定对亲子关系的判定呢？可能会。概率低。如果有这些情况，则需要具体问题具体分析，可以用其他方面辅助验证，如生物学SNP分型检测。以及拿被存在异议的个体的DNA数据参与比对分析，就可以知道是什么的结果。因此，在对亲子鉴定的检测的时候，避免就可以。不能把想象带到科学技术的判定中。要以科学的技术手段分析存在的结果。
