亲子鉴定分为个人亲子鉴定和司法亲子鉴定。在个人亲子鉴定中单亲亲子鉴定占90%以上，父母双方亲子鉴定的较少；司法亲子鉴定父母双方亲子鉴定占60%左右，司法亲子鉴定有些是要求父母双方都参与的。那么单亲亲子鉴定和双亲亲子鉴定有什么区别呢？
1、精确度上，一般单方亲子鉴定可以精确到亲权概率大于99.99%，双方亲子鉴定可以精确到亲权概率大于99.9999%。绝大部分双方亲子鉴定是比单方亲子鉴定更精确的，当然有的家庭单方亲子鉴定也是可以达到亲权概率大于99.9999%的，只是同一个家庭双方亲子鉴定肯定是单方亲子鉴定更精确的。
2、单亲亲子鉴定可能存在单亲亲子鉴定风险。即在亲子鉴定时发现亲代到子代的遗传过程发生基因突变现象，需要做双亲亲子鉴定作进一步确认。
3、司法效力上，单亲亲子鉴定有时候还存在，因忽略另外一方未参与或未知情，存在对结论的否定，需要重启双亲的亲子鉴定。
否定的亲子关系，当做单亲亲子鉴定时，父亲和小孩比对会有多个基因座不符合遗传规律，当加入未参与方时（一般为孩子生母），会发线可能存在可疑父有更多的基因座位点和孩子不符合遗传规律。这是因为当某个基因座位点孩子的位点数字和父亲相同的部分来自生母时，这个位点的孩子和父亲相同的位点数字就不是来自父亲的，而是来自母亲的，该位点孩子和父亲也是不符合遗传规律的。
总之，孩子的遗传一半来自母亲，另一半来自父亲。但由于人类遗传因环境的影响存在1.4%的基因突变，当出现大人和孩子存在三一下（包含三个）基因座位点不符合遗传规律时，就不能简单的排除大人和孩子的亲子关系关系，需要增加检测未参与方的样本，做双亲亲子鉴定。
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