亲子鉴定的第一步就是样本的DNA提取。DNA提取有哪些方法呢？DNA提取通常有三种提取方式：手工提取、半自动提取（代替手工提取中的一些步骤）和全自动提取（无需手工，放入检材，取出提取好的DNA进行扩增）。
一、手工提取
1.Chelex-100提取法:Chelex-100是一种化学鳌合树脂,由苯乙烯.二乙烯苯共聚体组成。其中含有的选择性螯合二价离子,比普通离子交换剂具有更高的金属离子选择性和较强的结合力，能结合许多可能影响下一步分析的其他外源物质。通过离心除去Chelex颗粒，使与Chelex-100结合的物质与DNA分离，防止DNA降解。
2.有机提取法：即经典的饱和酚-氯仿法。它利用有机的蛋白质变性剂酚、氯仿交替抽提，使蛋白质变性，有效地去除蛋白质等杂质。有机提取法能获得较多的大片段DNA，比Chelex-100提取方法能更彻底地纯化DNA。
3.无机提取法：利用6mol·L-1 NaCl或醋酸钠沉淀蛋白质代替有机酚-氯仿抽提步骤去除蛋白质，其他过程同有机溶剂提取法。
4.差异裂解法：主要用于混合精斑中的精子DNA提取。依据精子细胞膜和核膜含有大量硫醇蛋白，含有丰富的二硫键，利用这一特性可将罪犯和受害人的DNA分析分开，便于最后结果解释。
5.磁珠提取法：利用磁性硅胶吸附白细胞，用细胞裂解液裂解细胞，从细胞中游离出来的DNA分子被吸附到磁性颗粒表面，蛋白质等分子不被吸附而留在溶液中。在磁场作用下，磁性颗粒与液体分开,回收颗粒，再用纯水或TE洗脱吸附的DNA。
6.硅珠提取法：在高浓度的硫氰酸胍的存在下，DNA被二氧化硅特异性地吸附，被吸附的DNA在没有硫氰酸胍存在下，DNA又从二氧化硅中释放出来。硫氰酸胍是高性能蛋白变性剂，可使蛋白质与DNA分离，在硅珠吸附前高速离心可去除变性的蛋白质等不溶物，吸附后的漂洗可去除溶液中PCR抑制物，DNA回收率高。
二、半自动提取。 通常使用半自动提取仪，本文以南京微略MW-AP48核酸纯化仪为例。特点如下：
1.适用范围广：对全血、血卡、唾液卡、人体骨骼、组织、精斑、接触性生物检材等多种生物样本均可分离出高质量核酸。
2.外形和内部设计：设计小巧，注重细节，外形美观兼顾实用，给实验室操作者带来不一样的体验，采用图形化用户界面、触控操作，可以新建、编辑和删除程序，内部可储存多个程序，方便不同检材的提取参数设置，并且实验舱内含有紫外消毒，避免再次提取时样本污染。
3.分离系统：磁性分离系统由磁棒与磁套组成。
4.快速便捷：具有独立温控加热槽，带紫外灭菌装置，采用直线电机，能带动磁力棒迅速对样本搅拌和混匀，整个提取时间20~30分钟，相当快速。还使用羟基磁珠，优化了裂解缓冲条件，较硅珠法DNA回收效率提高1倍以上。
5.独立的配套试剂盒：包含手工提取使用的蛋白酶K、DTT和磁珠提取全套试剂，一个盒子满足全套服务。
6.样品通量：1~48道，可以一次性处理48个样品，处理体积20μL~1000μL, 操作灵活简便，
操作步骤如下：将处理好的检材移入核酸提取仪配套预封装试剂96孔深孔板中的样本孔，打开仪器舱门，放入96深孔板和搅拌套，关闭舱门后启动提取仪，提取仪首先可以对样本加热升温进行细胞裂解，然后由磁棒和搅拌套来吸附磁珠并移至样本孔，待磁珠上吸附了裂解释放的核酸后，再通过磁棒和搅拌套将磁珠转移至清洗孔。 核酸提取制备的整体步骤：
之后，将提取好的DNA加入到96孔板对应孔中，再添加检测试剂，具体方法按各厂家试剂盒说明书使用方法进行配置添加。试剂添加完毕后，使用封膜机将96孔板封上，然后放置到扩增仪上进行扩增，扩增程序按各厂家检测试剂盒说明书上的扩增步骤进行设置，扩增时间按检测试剂盒扩增时间算，扩增完成后经传递窗口将样本传递至测序室。测序室配置好相应的试剂耗材，将扩增产物加入相应的试剂耗材中，使用测序仪上样电泳，待测序完毕后导出检测图谱，进行图谱分析，便可以获得嫌疑人或被害人DNA信息。
三、全自动提取
全自动核酸提取仪相对前两者更加方便快捷，可实现放入检材取出后直接扩增DNA，目前市面上已有多款产品，但设备价位较高是最大的限制因素。
亲子鉴定一般采用的是Chelex-100提取法提DNA。
