亲子鉴定的样本分为常规样本和特殊样本。
常规样本有：血痕、口腔拭子、毛发（带毛囊的）；
特殊样本有：烟头、羊水、指甲、口香糖、蜡块、牙刷、口杯、吸管、肌肉组织、经血、鼻血、纯精斑、胎儿流产物、混合精斑等。
特殊样本相对于特殊样本存在提前难度大一些，样本处理的时间长一些，检出率低一些，可能还存在多次检测重复验证的现象，因此特殊样本平时在检测的时间收费会高一些。
特殊样本做亲子鉴定用得比较多的指甲和烟头。这两种样本检出率在95%一样，同时，委托人比较容易在当事人不知情的情况下采集到或收集到。同时还有牙刷样本在生活中，也比较容易获得，但是由于牙刷需要近期使用超过两个月以上，才有90%以上的检出率，不确定的情况下一般只有60%左右的检出率。
