1994年6月12日晚，Nicole Brown Simpson和Ronald Goldman在Nicole家中被残忍地杀害。几天之后，Nicole的前夫——Orenthal James Simpson被洛杉矶警方逮捕，成为该起谋杀案调查的主要嫌疑人。因为Simpson成功的橄榄 球生涯和声望，该案件立即引起公众的关注。从犯罪现场收集到上百件生物证据，主要包括滴落的血和血痕。DNA样本被送往三家实验室进行检验。
1994年夏末，洛杉矶警署DNA (LAPD)实验室、伯克利的加利福尼亚司法部门(CADOJ) DNA实验室及马里兰州一家名为“细胞标记诊断”的私立实验室用RFLP和PCR技术完成了DNA检测。这起案件中检测了大量的RFLP和DNA遗传标记，但并未进行STR分型。
被冠以“世纪审判”的Simpson案件庭审于1994年秋开始。Simpson雇佣了“梦幻组合”律师团努力为其洗脱嫌疑。Simp。on的辩护律师清楚地知道DNA证据是对这位橄榄球明星控罪的最有力证据，因此强烈攻击对犯罪现场生物性物证的采集过程。辩护团控诉样本采集和处理过程的不合理、警方的阴谋吸实验室污染，最终成功提出了一些“合理的疑点”。经过漫长枯燥的审判后，陪审团于1995年10月3日宣布Simpson无罪。
LAPD采集了7套血痕，由上述三家实验室对其进行分析。有关这些样本的描述及辩护团的质疑详见后述。对于每个样本而言，计算所得的随机匹配概率为1/40～1／400亿。如果仅用PCR检测DQ-alpha遗传标记，随机匹配概率为1／40，但应用RFLP遗传标记检测时，其随机匹配概率超过1/400亿。为了更好地突出DNA分析在Simpson案件中的重要性，CADOJ接受了LAPD提供的61项证据。所有这些证据包括：从22个不同位置提取的108份样本和同时提取的21个质控样本，以及24个提取试剂空白对照。这些试剂空白对照的设置旨在证
明CADOJ实验室不存在样本间污染。从科学的角度看，3个检测实羞室的结果相同，检测超过20个DNA遗传标记，并且不能排除犯罪现场的样本不是Simpson先生的。宣判无罪的裁决表明DNA证据并不总是被理解而且很难向大众解释清楚。专家组成员必须将DNA生物学、DNA分析技术和遗传学之类难以解释的问题解释清楚，而陪审团成员则必须明了诸如污染和混合斑的分析等问题的复杂性。
为了利于辩护，辩护团将焦点集中在证据的收集和保存问题上，而不是去置疑DNA检测结果的有效性。他们暗示LAPD利用在案发第2天（6月13日）采集的Simpson的对照血样伪造证据。而且他们还攻击LAPD DNA实验室盼证据处理方式，断言由于其拖沓的工作和实验室不能保证消毒的环境，导致了Simpson的对照血样作为证据的样本受到污染。
污染问题成为双方争论的焦点，在样本打包被送往其他实验室进行进一步检测之前，许多证据在LAPD实验室被打开、处理，很可能被污染。因此，辩护方认为，无论伯克利的加利福尼亚司法部门(CADOJ)或“细胞标记诊断”私立实验室怎么认真处理样本，它们的检测结果并不能如实反映犯罪现场的真实情况。既然样本被假定在LAPD窦验室已经被污染，辩护方认为证据并不十分可信。然而，全部的DNA证据都指向Simpson，这让人很难相信一些随机的实验室错误就可能导致绝对性的无罪判决。
自1995年Simpson案件宣判后，法医DNA实验室在进行DNA证据收集和检测时提高了警惕，以便不再被质疑。由于PCR技术十分灵敏，实验室在实验过程中必须采取特殊手段以防止实验室内部污染。因此，为确保实验室能正确引导案件调查并具有专业能力，有必要对实验室进行水平评估和常规熟练度检测。
DNA咨询部质量保证标准的发行有助于提高法医DNA检测的专业现状。值得注意的是，根据最近的研究，对实际案件检验中常见的环境条件进行系统分析，并没有发生PCR污染。只有在明显偏离基本预防措施（如那些DAB标准）时才会出现明显的污染，而粗心的操作不一定会导致污染。由此可见，Simpson案件给我们的最重要的警示在于将重点重新放在DNA采集上。
