近年来,法医DNA分型集中于具有高度多态性、易区分无关个体的STR遗传标记。虽然使用相当数量的SNP方能获得与STR相似的随机匹配概率,但由于SNP在其他方面的潜力,因而可协助调查案件,如预测罪犯的祖先的遗传背景。与STR相比,SNP突变率相当低,因而更易在人群众稳定遗传。SNP大约在108代中发生一次突变,而STR突变率约为1/1000。正因为它们的突变率低,SNP和Alu插入常被作为人群特异性标记。这些位点在帮助调查案件、预测罪犯的种族起源时是非常有用的。
特殊人群众存在的稀有STR等位基因或SNP位点用于预测样本的种族起源。尽管投入了很大精力去研究STR预测种族起源,但与证据的要求仍然有很大的距离。具有混合祖先背景的个体可能并不拥有所期望的表型证据(如非裔美国人的黑皮肤)。因此,尝试预测种族来源或者家系的基因检测的结果经常会有疑问,只能依赖于其他可信的证据。
美国佛罗里达州的一家名为DNAPrint的公司曾尝试着用一组含有56个SNP的检测方法预测一名受试个体的种族背景。DNAPrint公司在寻找含种族信息的SNP时,将目标定在色素沉着和异生物质代谢基因上,它们的工作基于Dr.Mark Shriver的研究,而这些研究者正致力于寻找具有家族遗传信息并且等位基因频率在人群中具有显著差异的家系信息遗传标记(AIM)。在STR和SNP遗传标记上都发现了“人群特异性等位基因”(PSA)。尽管当前应用AIM进行样本种族背景预测并不完全正确,但2003年DNAPrint的SNP分型方法被用于协助调查一个重要的连环强奸案,这一事实说明了这一分型技术在法医学领域的价值。