染色质中DNA和蛋白度大约各占一半，DNA和蛋白质均是大分子物质。提取DNA的基本原理是利用DNA和蛋白质对提取过程中各种试剂如蛋白酶、有机溶剂（苯酚、氯仿、乙醇）等不同的反应或溶解性来达到彼此分离的目的。一个典型的提取程序包括下面四个步骤：
(1)在弱碱和螯合剂存在的条件下进行组织匀浆，溶解细胞或细胞核膜。
(2)利用去垢剂和蛋白酶消化蛋白质，分离DNA。
(3)用有机溶剂如苯酚、氯仿，除去残余蛋白质，萃取DNA。
(4)用乙醇或某些盐类从溶液中沉淀DNA。
以酚／氯仿抽提为主的有机溶剂提取法是DNA提取的经典方法，用这些方法可获得100~ l000kb左右的基因组DNA，而且提取的DNA纯度高，可用于RflPs以及以PCR为基础的所有法医DNA分析技术。
