父或/和母已亡，或因某种原因不能参与检验，为了认亲、移民、继承财产、入户等，要求进行隔代、同胞或叔侄、姨甥等旁系人员间的亲权鉴定。隔代、同胞或旁系之间的亲权鉴定原理与鉴定父母子关系的原理一样。
某单位曾遇数例类似案件，现将其中1例介绍如下：非婚生子，父因车祸死亡，祖父母欲让男孩继承父遗产，但儿媳妇不同意，故进行隔代亲权鉴定，间接认定父子关系。该例共鉴定祖父、祖母、叔叔、姑姑、孩子生母和孩子6个人的遗传标记，检验结果如表1。
表1 各遗传标记检验结果
遗传标记 祖父 祖母 叔叔 姑姑 母 男孩
ABO O A O A 0 0
MN MN N MN MN N MN
Hp 2 2-1 2 2-1 1 2-1
EsD 2-1 1 - - 1 1
HLA-A 2,33 11,33 11,33 2,33 2,9 9,33
HLA-B 46，x 60,17 60,x 46,27 35,16 37,17
TH01 192, 200 196, 200 200 192, 196 200, 204 192, 204
PLA 124, 136 132, 136 132, 136 132, 136 128, 136 132, 136
SE33 298 298, 270 - - 282, 310 298, 310
D19S253 229 233 - - 233 229, 233
VWF-40 300+248+240 308+280+228 308+280+228 300+248+248 304+284+228 300+248+240
300+248+248 292+248+244 300+248+240 292+248+244 296+248+244 296+248+244
DYS19 199 199 199
DYS389 261,381 261,381 261,381
DYS390 219 219 219
根据检验结果，孩子的生父基因均可在祖父、祖母的遗传标记中找到，故不能排除他们之间有亲缘关系。根据祖父、祖母各种遗传标记的组合，推出孩子生父基因频率(x)与随机人群生父基因频率(y)比较，同样可以计算亲权指数。
以上述例子说明：
(1) MN血型：从母子组合知，生父基因为M基因，从祖父、祖母的表型推测，他们的 子女中50%为MN型，50%为N型，故传递给男孩M基因的频率为0.5×0.5= 0.25；
(2) D19S253基因座：生父基因为229，推测祖父、祖母的子女100%为D19S253 229 -233型，传递给男孩229基因频率为1×0.5= 0.5;
(3) SE33基因座：生父基因为298，推测祖父、祖母的子女50%为298型纯合子，50%为298 -270杂合子，故传递给男孩298基因频率为0.5×1+ 0.5×0.5= 0.75;
(4) ABO型：根据叔叔、姑姑的ABO型，可推测祖父、祖母的基因型分别为00和AO，他们的予女中50%为AO基因型，50%为OO基因型，故传递给孩子0基因的频率为0.5×0.5+ 0.5×1= 0.75；
(5) HLA型：根据叔叔、姑姑的HLA型，可推测祖父、祖母的基因型分别为HLA - A2， B46/A33，Bx和HIA - All，B60/A33，B17，他们的子女可有4种基因型：A2，B46/A33， B17、A2，B46/All，B60、A33，Bx/A33，B17和A33，Bx/All，B60，每种基因型概率为0.25，其中2种基因型可传递A33, B17单倍型，所以传递生父基因A33, B17频率为0.25×0.5+0.25×0,5= 0.25；
(6)男孩从爷爷得到Y- STR基因座的生父基因频率为1。
祖父、祖母遗传给男孩生父基因频率见表2。
表2 祖父、祖母传递生父基因频率
ABO MN Hp EsD HLA TH01 PLA SE33 D19S253 VWF-40
生父基因 0 M 2 1 A33,B17 192 132 298 229 300+248+240
频率 0.75 0.25 0.75 0.25 0.25 0.25 0.25 0.75 0.5 0.25
受检对象之间有祖孙关系的PI值为370927.27, RCP为99 .9997%；根据检验结果，叔叔与孩子有TH01和HIA两系统违反遗传规律，故叔叔不是孩子的生父。法院调查后确认祖父母只有二个儿子，男孩既与他们有祖孙关系，又不是叔叔的儿子，从而间接认定是已故父亲的亲生子。
