毛发分毛根、毛干、毛尖三部分。毛根含有染色体DNA，但自然脱落的毛发根部含染色体DNA量极少。毛干部分含有线粒体DNA，随着近年来测序技术的发展，通过毛干mtDNA测序作个体识别已经成为较常见的技术。
（一）毛根DNA提取
1．有机提取法：
(1)取带毛根的毛发1根用乙醚洗涤去油脂，乙醇清洁表面，干燥。
(2)将单个发根剪入1.5ml离心管中，加入100µl TES(100mmol/L NaCl，10mmol/L EDTA，10mmol/L Tris - HCl pH8.0)、10% SDS 10µl和10mg/ml蛋白酶K 1µl，混匀，55℃水浴2h或37℃温浴过夜。
(3)用等体积饱和酚、酚／氯仿、氯仿各抽提一次。
(4)加1/10体积3mol/L醋酸钠（pH5.2），2倍体积预冷无水乙醇，混匀，沉淀DNA。10000r/min离心10min，弃去上清。
(5)真空干燥，10µl消毒去离子水溶解DNA备用。
2．Chelex - 100提取法
将0.5cm发根剪入1.5ml离心管中，灭菌水、乙醇分别清洗两次，晾干后加入5﹪Chelex - 100 50µl～100µl，以下步骤同Chelex - 100提取血液DNA。
3．直接煮沸法
将单个毛根剪入1.5ml离心管中，灭菌水、乙醇分别清洗两次，晾干后加入50µl～100µl灭菌水，沸水煮10min，4℃备用。
（二）毛干mtDNA提取
1．取lcm长毛干，用乙醇擦拭，放人1.5ml离心管中。
2．灭菌水、无水乙醇分别浸泡两次，每次10min。
3．晾干后如入64µl TES(10mol/L Tris pH8.0，10mmol/L EDTA，100mmol/L NaCl)，10﹪SDS 20µl，10mg/ml蛋白酶K8µl，1mmol/L DTT 8µl，混匀，37℃温浴消化过夜。
4．待毛干消化完全后，等体积酚氯仿抽提，收集上清备用。
相关评论：
科鉴基因来自河北廊坊的客户反馈：一年的毛发未检测出，二岁多的小孩毛发样本检测出。
2015年做的个人亲子鉴定，大人采集的带毛囊的头，但是放置了有一年多，小孩的二岁多，也采集的带毛囊的头发，送到鉴定中心，说是最好提供五岁以上两根拔起的毛发，两种样本都是不符合标准要求的，样本已经送到鉴定中心，想检测看看，一周左右，实验完全，孩子的毛发样本检测到DNA数据，大人的没有检测到，可能是放置的时间太长。之后2016年好不容易补到大人的毛发样本，就很快送到鉴定中心。检测得到大人的DNA数据，与之前检测的小孩的DNA数据比对，得到结果。
科鉴基因来自河北固安的客户反馈：2根带毛囊的头发到北京做亲子鉴定。
2016年做的个人亲子鉴定，当时只采集男方的两根毛发，毛囊很明显，且能粘在纸上。到鉴定中心知道毛发要求五岁以上两根拔起最少五根带毛囊的。两根有点少，如果检测结果不够，可以补样加测或是重新检测。一周左右，得到结果。
