一、 原理
当检材较少时或者基因分型只需要少量的DNA时,可以用Chelex-100提取方法提取DNA。Chelex-100是一种化学整合树脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成。含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,整合多价金属离子,尤其是选择性整合二价离子,比普通离子交换剂具有更高的金属离子选择性和较强的结合力.能结合许多可能影响一步分析的其他外源物质。通过离心除去Chelex-100颗粒,使这些与Chelex-100结合的物质与DNA分离,防止结合到Chelex中的抑制剂或杂质带到PCR反应中,影响下一步的DNA分析,并通过结合金属离子,防止DNA降解。
二、实验目的
掌握各种法医学生物检材DNA提取方法。
三、仪器设备
干热器、恒温水浴箱、高速离心机、离心管
四、试剂
Chelex-100法提取生物检材所需试剂的配制
1. 5% Chelex-100 (w/v)
称取5克Chelex-100,加100ml灭菌纯水,放4℃保存。
2. 10% SDS
称取10克优级纯的SDS,加纯水到100ml溶解,室温保存。
3. 5mg/ml PK酶(蛋白酶K)
称取5mg PK酶,溶于1ml灭菌纯水中,-20℃保存。
4. 1M DTT (二硫苏糖醇)
称取154.3mg DTT加1ml灭菌纯水溶解,-20℃保存。
五、 实验方法---Chelex-100法
1. 全血
1) 取3~10μl全血加到0.5ml离心管中,加人500μl纯水,剧烈振荡,室温下放置15分钟。
2) 13,000rpm离心3分钟,去上清,收集沉淀。(必要时可用蒸馏水反复洗沉淀物,直至无色或血色素很少)。
3) 沉淀中加入200μl 5% Chelex-100溶液(5% Chelex-100为悬浊液,使用前要充分振摇,使Chelex-100颗粒悬浮),在振荡器上反复振荡,放入56℃保温30分钟以上。
4) 取出后振荡,100℃保温8分钟,振荡后,13,000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增,或放4℃保存备用。
2. 血斑
1) 剪取约0.5cm2的血斑,加到0.5ml的离心管中,加入500μl纯水,剧烈振荡,室温放置15分钟。13,000离心3分钟,去上清。(可用纯水反复洗至无色,载体不需去除,始终留在离心管中。)
2) 以下步骤同全血的提取方法。
3. 混合斑
1) 取适量含有混合斑的检测,剪碎后放入5ml小烧杯中,加入3ml纯水、300μl 10% SDS及150μl 5mg/ml 的PK酶,用牙签搅拌后,放入37℃水浴6小时以上(最好过夜)。
2) 将水浴好的检材移入1.5ml离心管(检材载体用一次性注射器挤压后去除),13,000rpm 离心3分钟,去上清,每管加1.4ml 纯水,振荡,13000rpm 离心3分钟。洗三次后,移入0.5ml离心管中,13000rpm离心3分钟,弃上清。
3) 向沉淀物的离心管中加入200μl 5%的Chelex-100(可根据检材量的多少进行调节),4μl 5mg/ml 的PK酶及8μl 1M的DTT(PK酶及DTT的终浓度分别为100μg/ml和0.039M),振荡后56℃保温过夜。次日取出振荡,100℃保温8分钟,振荡,13000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增或放4℃保存备用。
4. 含有唾液斑的检材
1) 唾液斑:处理方法与血斑的处理方法相同。
2) 烟头: 用镊子夹住烟头,剪刀剪下烟头外圈的纸,剪碎后放入0.5ml离心管中,加人500μl纯水,剧烈振荡,13000rpm离心3分钟,弃上清,加入100μl 5% 的Chelex-100,放入56℃保温30分钟以上。取出振荡,100℃保温8分钟,13000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增或放4℃保存备用。
3) 口香糖:将口香糖剪碎后放入0.5ml离心管中,加人500μl纯水,剧烈振荡,13000rpm离心3分钟,弃上清,加入100μl 5% 的Chelex-100,放入56℃保温30分钟以上。取出振荡,100℃保温8分钟,振荡,13000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增或放4℃保存备用。
5. 毛根
用镊子夹住毛发的根部,剪去其余部分,将毛根放入0.5ml离心管中(处理毛发时很容易遗失,应小心操作,最好在桌面上铺一张白纸。),加人纯水洗一次,然后加入30μl 5%的Chelex-100和2μl 5mg/ml 的PK酶,放入56℃保温6小时以上。取出振荡,100℃保温8分钟,振荡,13000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增或放4℃保存备用。
6. 肌肉与脑组织
取小米粒大小的肌肉或脑组织,放入0.5ml离心管中,加人纯水洗一次,然后加入200μl 5%的Chelex-100和 5μl 5mg/ml 的PK酶,放入56℃保温3小时以上。取出振荡,100℃保温8分钟,振荡,13000rpm离心3分钟,上清用于PCR扩增或放4℃保存备用。
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