亲权排除主要是通过分析受检者之间的遗传标记是否遵循遗传规律而进行的。某些遗传标记组合并不能提供排除信息，如在母子关系已确定的亲子鉴定，母子均为A型，生父基因为A或O基因，意味着任何一种ABO表现型的男子都不能排除。当母为O型，孩子为A型，则A型、AB型男子不能排除为生父。O型、B型男子才能被排除。又如母为FGA23，子为FGA23-25，只有不具有FGA25基因的男子才能被排除为生父。因此对于每一个遗传标记系统，在所有可能的各种组合中，只有带有某些遗传标记的争议对象才能被排除有亲权关系，另外一些则不能被排除，即存在排除概率（excluding probability ，EP），确切地说是非父排除概率（probability of excluding paternity，PE)。
非父排除概率又称父权排除概率（excluding probability of paternity，EPP)，指通过检测某个遗传标记（genetic marker，GM)系统，能将不是生父的假设父亲排除的机会，是衡量一个遗传标记系统排除父能力的一个客观标准，表示在所有非父被控为生父的男子中，用改GM系统否定父权有多大的可能性。在中国汉族人HLA-B系统的非父排除概率为0.8071，则表示100名非父通过检测HLA-B抗原，理论上可排除80.71名；ABO系统的非父排除概率为0.1892，则在100名非父中只能排除18.92名，HLA-B系统的非父排除概率大于ABO系统。
