亲子鉴定的准确度能达到100%。但是位点数的多少能决定他的精确度，位点越多就越能解决特殊情况下来确定我们对这项技术结论的判断。
1. 只有1个遗传标记违反遗传规律时不能轻易做出排除的结论。排除亲子关系，必须加测其他系统。因为对于不是生父的男子，随着检测项目的增加，必须还有其他遗传标记可排除亲子关系。若增加检测项目，排除遗传标记不再增加，则可考虑原来排除的那1个遗传标记是由突变或非典型遗传方式造成的，此时若亲子关系相对机会已经超过0.9995，则可作出认定结论。
2. 有2个遗传标记违反遗传规律时，要根据具体情况分析：
①2个血型遗传标记，如ABO、HLA违反遗传规律，则可作出排除结论。
②1个血型遗传标记直接违反遗传规律时，1个DNA遗传标记违反遗传规律时，且假设父与孩子均为杂合子，如假设父为FGA21-25，子为FGA16-18，则可否定假设父为生父。
③2个DNA遗传标记违反遗传规律时，需慎重对待，宜加测遗传标记后再具体分析，加测标记数目要使CCE值达到0.9997以上。
3. 有3个及以上遗传标记违反遗传规律时，则可作出排除亲子关系的结论。因为假设DNA单一基因座突变率为0.002，三个位点同时突变造成的错误排除概率仅为4×10-9。
根据多年来的实践经验，只要检验足够多的遗传标记，如检验费父排除率较高的13个STR基因座，加1～2个VNTR基 因座或HLA系统，CCE已超过0.9999，无亲生关系的受检者之间几乎有3个以上遗传标记违反遗传规律，2个遗传标记违反遗传规律的是极少数，不可能出现1个遗传标记违反遗传规律，而否定亲生关系。
