血型测定是亲子鉴定所采用的经典方法，在近代亲子鉴定实际工作中起了相当大的作用，并且至今还起着重大作用。血型测定一般方法简单，对仪器设备要求较低，检测结果判读直观，投资较少，容易在基层部门普及。所谓血型测定，实际上主要是检测检测捡材中某个血型系统的的表型，也能得出排除亲子关系的结果。在一些认定亲子关系的案例中，也能得到很高的亲子关系概率。
DNA检测分型有其明显的优势。随着人类基因组DNA认识的逐步深入及DNA检测技术的日趋完善，相信该检测在亲子鉴定中继续发挥主导作用，甚至可以逐步取代血型检测。
根据遗传标记外的其他指标，理论上也可对某些亲子鉴定得出排除的结论。例如，根据妊娠期限推断受精日期，若能证明在生母受精期间，有争议的男人不可能与她同居，便可否定该男子为孩子的亲生父亲。受孕妇女正常的妊娠期为280天（40周）±14天，法医学上可根据分娩日期推算受精时间。但也有报告有性交后长达329天才分娩者（过熟儿），或者短至28周娩出具有生活能力的婴儿者（未熟儿）。也可根据胚胎发育各阶段的标志来推算孕期，作胎儿的亲子鉴定。
另外，若有证据表明有争议的父（或母）在受精期间无性交能力或生育能力，也能否定亲子关系。若各种障碍引起的男子阳痿，精液异常、精子缺乏或畸形，先填或后天原因所造成的尿道畸形或损伤及射精不能；功能性异常或器质性病变而导致的女子性交不能，内生殖器官异常及病变所致不能排卵，卵子发育不能，输卵管阻塞等。但这类证据有时较难确认，因为当某些障碍或病变较轻微时，仍有可能导致受精并生育，尤其是许多情况下，较难准确地回溯受精期间的性功能及生育功能；一些后来的这方面的诊治报告及记录往往不一定能真实地反映当时的实际情况。在鉴定中，根据当事人陈述要求鉴定的目的，了解和掌握有关当事人双反性生活及妊娠与分娩等有关情况，可以作为鉴定结论的参考。
