在美国每年有超过30万例的亲权案件，这些案件的争论的焦点是：谁是孩子的生物父亲。这类案件通常包括母亲、孩子一个或多个被控父亲。2002年仅美国需进行父权鉴定的样本数将近100万。许多不同的实验室都在受理亲权鉴定（亲子鉴定）案件。
亲权鉴定（亲子鉴定）通过检验一系列遗传标记，判断被控父亲和孩子是否拥有共享等位基因。因此，亲子关系的结论要么是肯定，要么是排除。亲权鉴定实验室检测方法与法医检测方法与法医鉴定实验室所用的方法相同，均使用短串联重复序列（STR）多个基因座复合扩增和商品化试剂盒。但是，并不是要求DNA分型结果的完全匹配，而是研究每个检验的遗传基因座中的非母系来源或“必须来自父系的等位基因”。
父权鉴定的理论基础可归结为：在没有突变的情况下，在每个检验的遗传基因座中，孩子拥有来自父母的各一条等位基因。这样，如果父母的基因型是11,14（父亲）和8,12（母亲），就可能产生以下几种基因型的后代：8,11、8,14、11,12、和12,14.相反，如果已知母亲的基因型是8,12，同一父系的孩子拥有8,11,12和14几种基因型，我们则可以推断父亲一定提供了11和14两种基因型。
