21位点的DNA鉴定是目前国内亲子鉴定中常用的最基础的选择标记的位点。D16S539是其中之一，具有是怎么的呢？
其为位于16号染色体长臂的简单四核苷酸重复。9个常见等位基因具有GATA核心重复，包括一个等位基因5和连续的等位基因8-15。Promega试剂盒比AB试剂盒相应基因座的PCR产物长31bp。位于STR重复下游38bp处的T→A点突变，对Promega和AB的反向引物都有影响。AB公司在其CofilerTM、SGM PlusTM、IdentifilerTM试剂盒中加入了一额外或“变性”的未标记引物，尽可能扩增所有的等位基因(Wallin et al.,2002)。另一方面，Promega改变试剂盒间该基因座的反向引物序列，但总扩增片段长度仍然相同(Butler et al.,2002)。PowerPlex®16反向引物比PowerPlex®1.1的3′端长5个核苷酸，使突变位于引物内部，避免引物错配导致等位基因缺失(Nelson et al.,2001；Krenke et al.,2002)。
