非父排除率作为系统指标反映某个遗传标记系统在亲子鉴定中排除父权能力的大小，故了解PE的意义：
1．作为选择用于亲子鉴定遗传标记的依据。为了达到最大限度排除非父的目的，提高信息量及排除假设父的效率，就必须选择排除率高的遗传标记系统。
2．作为衡量亲子鉴定实验室的质量控制标准。累积非父排除率越高，排除非父的机会亦越高，若假设父不被排除，肯定其为生父的机会也越高；如CCE低，非父被排除的机会低，此时即使某一假设父的父权指数较高，得出有亲子关系的结论也应慎重。
目前认为开展亲子鉴定工作的实验室，其所检测遗传标记的累积排除概率至少应在0.9995以上。理论上，CCE达0.999，一个非父可被一个遗传标记排除，CCE达0.9995，一个非父可被二个遗传标记排除。目前在亲子鉴定中广泛应用STR分型，突变率较血型系统高，以最大允许个遗传标记发生突变为前提，CCE也应该达0.9995。
