设某一SrIR基因座Pa= 0.1,pb=0.2
1.标准个案母bc型,子ab型,假设父ad型。
比对母子组合,只有一种生母基因,所以母传递b基因频率为1,计算PI值时可不考虑母传生母基因频率。生父基因为a基因。x=假设父传a基因频率=0.5,y=随机父传a基因频率即pa= 0.1,
PI=0.5/0.1=5
2.双亲皆疑假设母bc型,子ab型,假设父ad型。
方法1:
x=假设父传a基因频率×假设母传b基因频率=0.5×0.5= 0.25,
y=随机父传a基因频率×随机母传b基因频率+随机父传b基因频率×随机母传a基因频率= 2pa pb=2×0.1×0.2= 0.04,
PI=0.25/0.04=6.25
方法2:
x同方法1,即x= 0.25,
y=随机父传a基因频率×随机母传b基因频率+随机父传b基因频率×随机母传a基因频率+假设父传a基因频率×随机母传b基因频率+随机父传a基因频率×假设母传b基因频率= PaPb+PaPb +0.5pb+0.5Pa=2PaPb +0.5(pb+Pa)=2×0.1×0.2+ 0.5 (0.1 +0.21)= 0.19,
PI=0.25/0.19=1.32
3.荜亲检验子ab型,假设父ad型。
X=假设父传a基因频率×随机母传b基因频率=0.5×pb=0.5×0.2= 0.1,
y=随机父传a基因频率×随机母传b基因频率+随机父传b基因频率×随机母传a基因频率= 2papb=2×0.1×0.2= 0.04,
PI=0.1/0.04=2.5
也可按ITO法计算PI: x=ψOO+ψ1T+ψ2I=0×2papb+l×1/2×pb+0×0=0.5pb
y= 2PaPb
PI= 0.5pb/(2PaPb) =11 (4Pa) =1/ (4×0.1) =2.5
4.隔代检验祖母bc型,假设孙子ab型,祖父ad型。
祖父母儿子的基因型可为ab、ac、bd、ed,每种基因型概率均为0.25,各有两种基因型可以遗传孙子a或b基因,所以孙子从祖父母得到a或b基因机会均为0.25(0.5+0.5)=0.25。由于假设孙子的母亲未参加检验,故
x=祖父母传a基因频率×随机母传b基因频率+祖父母传b基因频率×随机母传a基因频率= 0.25×pb+0.25×Pa= 0.25×0.2+ 0.25×0.1= 0.075,
y=随机父传a基因频率×随机母传b基因频率+随机父传b基因频率×随机母传a基因频率= 2papb=2×0.1x0.2= 0.04,
PI=0.075/0.04:1.875